Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC8Q9H0W5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC8Q9H0W5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC8Q9H0W5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms