Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SHARPINQ9H0F6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHARPINQ9H0F6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms