Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP44Q9H0E7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP44Q9H0E7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP44Q9H0E7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP44Q9H0E7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms