Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZW8

MS4A7, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A7Q9GZW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A7Q9GZW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A7Q9GZW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MS4A7Q9GZW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms