Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LNPKQ9C0E8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LNPKQ9C0E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LNPKQ9C0E8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LNPKQ9C0E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms