Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E4

GRIP2, Glutamate receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP2Q9C0E4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIP2Q9C0E4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIP2Q9C0E4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms