Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT23Q9C075 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT23Q9C075 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT23Q9C075 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms