Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRY4Q9C004 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRY4Q9C004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms