Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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TM6SF1Q9BZW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
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TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TM6SF1Q9BZW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM6SF1Q9BZW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
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TM6SF1Q9BZW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TM6SF1Q9BZW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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TM6SF1Q9BZW5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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TM6SF1Q9BZW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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TM6SF1Q9BZW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM6SF1Q9BZW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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