Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXP3Q9BZS1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXP3Q9BZS1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms