Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL1Q9BYD6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MRPL1Q9BYD6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL1Q9BYD6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms