Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5DQ9BY66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM5DQ9BY66 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM5DQ9BY66 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.2 ms