Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GABARAPL3Q9BY60 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABARAPL3Q9BY60 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms