Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRIP1Q9BX63 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BRIP1Q9BX63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRIP1Q9BX63 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms