Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RSRP1Q9BUV0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSRP1Q9BUV0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms