Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TXNDC17Q9BRA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms