Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYT3Q9BQG1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT3Q9BQG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms