Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOPXQ9BPY8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOPXQ9BPY8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms