Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGPAT1Q99943 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGPAT1Q99943 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGPAT1Q99943 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms