Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC1Q99614 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC1Q99614 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC1Q99614 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC1Q99614 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms