Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF3RQ99062 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF3RQ99062 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms