Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNKPQ96T60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PNKPQ96T60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms