Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP1Q96S65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CSRNP1Q96S65 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CSRNP1Q96S65 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP1Q96S65 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms