Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF396Q96N95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF396Q96N95 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF396Q96N95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF396Q96N95 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms