Protein–RNA interactions for Protein: Q96N23

CFAP54, Cilia- and flagella-associated protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 3,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP54Q96N23 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP54Q96N23 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP54Q96N23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP54Q96N23 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms