Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF145Q96MT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF145Q96MT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms