Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM20AQ96MK3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM20AQ96MK3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FAM20AQ96MK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM20AQ96MK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms