Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC42Q96M95 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC42Q96M95 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC42Q96M95 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms