Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CCDC7Q96M83 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC7Q96M83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC7Q96M83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms