Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC17Q96LX7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC17Q96LX7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC17Q96LX7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms