Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGCZQ96LD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCZQ96LD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCZQ96LD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.7 ms