Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC41A2Q96JW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC41A2Q96JW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC41A2Q96JW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms