Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF2Q96GP6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCARF2Q96GP6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCARF2Q96GP6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCARF2Q96GP6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms