Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IMP4Q96G21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IMP4Q96G21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IMP4Q96G21 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms