Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAMBPL1Q96FJ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STAMBPL1Q96FJ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms