Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVB12AQ96EY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MVB12AQ96EY5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MVB12AQ96EY5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms