Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJA3Q96EY1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJA3Q96EY1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNAJA3Q96EY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms