Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MFSD3Q96ES6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MFSD3Q96ES6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD3Q96ES6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms