Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF31Q96EP0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF31Q96EP0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms