Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTERF3Q96E29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTERF3Q96E29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTERF3Q96E29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms