Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB2Q96DC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB2Q96DC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB2Q96DC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms