Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF1Q96CC6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDF1Q96CC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDF1Q96CC6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms