Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMIGD2Q96BF3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIGD2Q96BF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIGD2Q96BF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms