Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC35C1Q96A29 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC35C1Q96A29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC35C1Q96A29 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms