Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPTSSAQ969W0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPTSSAQ969W0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPTSSAQ969W0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms