Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RFKQ969G6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RFKQ969G6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RFKQ969G6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms