Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCE1Q969G3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCE1Q969G3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCE1Q969G3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms