Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HPS3Q969F9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms