Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX13Q92968 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX13Q92968 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PEX13Q92968 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms