Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF4BQ92750 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4BQ92750 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4BQ92750 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms